最新のOracle(10月25日付け)では、Krovikan Horror の最初の能力は以下のようになっています。

At end of turn, if Krovikan Horror is in your graveyard with a creature card directly above it, you may return Krovikan Horror to your hand.

ターン終了ステップ開始時点で墓地になければ、この能力は誘発しません。
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「ターン終了です」という宣言は、一般的には『あなたが何もしないのであれば、私のターンを終了するので、あなたのターンに入ってください』と解釈されます。ですから、非アクティブ・プレイヤーは何らかの行動を取るのであれば、それをいつ行なうのかも明確に宣言しなければなりません(本来は)。

御質問にあるような状況で、ジャッジとしてどのように裁定すべきかというのであれば、まず《ゾンビの横行》のコントローラーにどの時点で能力を使用するのかを確認することが必要でしょう。その上で注意(RELによっては警告)を与えて、その後該当プレイヤーが望むフェイズからゲームを再開するのが妥当でしょう。

ＧＰ仙台(もしくはＰＴ大阪予選)に備えた質問ということであれば、
無用なトラブルを避けるために「第二メインフェイズ(戦闘後メインフェイズ)に」という宣言を行なうことを『強く』お勧めします(^−^)